総務課
総務課は，経済取引局内の事務の総合調整を行っているほか，各省庁が立案した法律案や各省庁が行う施策が，公正で自由な競争を制限したり，阻害したりすることのないよう各省庁と調整をしています。
また，発注機関における入札談合等の未然防止のために，発注機関の担当者を対象とした研修会の実施，入札・契約制度についての調査等にも取り組んでいます。
企画室
企画室では，競争政策に関する基本的事項の中長期的な観点に立った企画・立案を行っています。具体的には，独占禁止法が今日の経済実態に適合したものとなるよう独占禁止法の見直し等を行っています。
デジタル市場企画調査室
デジタル市場企画調査室では，デジタル市場についての取引実態の把握，知見の集積，調査を踏まえた分析や独占禁止法上の考え方の整理やガイドライン等の見直しなどの検討・企画立案を行っています。
調整課・企画官
調整課は，主として政府規制の強い特定の事業・業界について各省庁が立案した法律案や各省庁が行う施策が，公正で自由な競争を制限したり，阻害したりすることのないよう，各省庁と調整をしています。
企業結合課・上席企業結合調査官
ある企業が別の企業と合併などを行うと，市場における競争が活発に行われなくなることがあります。
このため，企業結合課では，一定規模以上の合併や株式所有などの企業結合について届出等を受け付けるとともに，個々の案件について，独占禁止法上問題とならないか審査を行い，競争が制限されることとなる場合には，計画の変更等の措置を講じさせています。
