公正取引委員会は、独占禁止法を運用するために設置された機関で、独占禁止法の補完法である取適法や、フリーランス・事業者間取引適正化等法、スマホソフトウェア競争促進法の運用も行っています。
国の行政機関には、○○省や◎◎庁と呼ばれるもののほかに、一般に「行政委員会」と呼ばれる合議制の機関があります。公正取引委員会は、この行政委員会に当たり、委員長と4名の委員で構成されており、他から指揮監督を受けることなく独立して職務を行うことに特色があります。
また、国の行政組織上は内閣府の外局として位置付けられています。